BBM skladuje vzorky a archivuje doprovodná data dle platných standardních operačních postupů (SOP). Cílem je zachování vysoké kvality vzorků. Jednotlivé údaje o skladování (počet alikvotů, pozice v příslušném skladovacím zařízení) se zaznamenávají do databáze BBM.

BBM využívá následující metody skladování:

• Skladování v mrazácích při -80°C (krev, sérum, plasma, DNA z periferní krve, vzorky tkání v RNA lateru)
• Skladování v parách tekutého dusíku při -156°C (vzorky tkání)