BBM 1. LF UK skladuje vzorky a archivuje doprovodná data dle platných standardních operačních postupů (SOP). Cílem je zachování vysoké kvality vzorků. Jednotlivé údaje o skladování (počet alikvotů, pozice v příslušném skladovacím zařízení) se zaznamenávají do databáze biobanky.
BBM 1. LF UK využívá následující metody skladování:
- Skladování v plynné fázi tekutého dusíku v robotickém systému při teplotě pod -150 °C (tkáně, sérum, plazma, likvor, moč, další tekutiny)
- Skladování v mrazácích při -80 °C (krev, sérum, plasma, DNA z periferní krve, moč, likvor, vzorky tkání v RNA lateru)
- Skladování v parách tekutého dusíku při -156 °C (vzorky tkání)

