Každou žádost o vzorky a doprovodná data posuzuje individuálně Schvalovací komise BBM 1. LF UK na základě těchto kritérií:

• Důvěryhodnost a kompetence žadatele a instituce žadatele
• Schválení projektu Etickou komisí příslušného pracoviště
• Použití vzorků/dat k výzkumu specifikovanému v informovaném souhlase dárce
• Dostupnost požadovaného vzorku
• Navrhované využití vzorků/dat je v souladu s cíli BBM 1. LF UK
• Potenciální vědecký impakt projektu (vysoký/nízký)
• Projekt vyhovuje vědeckým standardům
• Jsou požadované vzorky vzácné?
• Zaměření strany žadatele: profit/non-profit
• Druh analýz prováděných na vzorku (včetně protokolu)
• Vhodnost požadovaných vzorků pro navrhovaný výzkum
• Dostatečnost/nadbytečnost požadovaného množství vzorků
• Výzkum není opakován jinými žadateli

1. Poskytování vzorků pro účely vědy, výzkumu a výuky
2. Zajištění sběru, přípravy a skladování vzorků
3. Skladování vzorků
4. Izolace a zpracování nukleových kyselin
5. Příprava a barvení histopatologických řezů
6. Dohledání nadstandardních dat ke vzorkům, konzultace ohledně kvality vzorků
7. Konzultace etických otázek

BBM 1. LF UK skladuje vzorky a archivuje doprovodná data dle platných standardních operačních postupů (SOP). Cílem je zachování vysoké kvality vzorků. Jednotlivé údaje o skladování (počet alikvotů, pozice v příslušném skladovacím zařízení) se zaznamenávají do databáze biobanky.

BBM 1. LF UK využívá následující metody skladování:

• Skladování v plynné fázi tekutého dusíku v robotickém systému při teplotě pod -150 °C (tkáně, sérum, plazma, likvor, moč, další tekutiny)
• Skladování v mrazácích při -80 °C (krev, sérum, plasma, DNA z periferní krve, moč, likvor, vzorky tkání v RNA lateru)
• Skladování v parách tekutého dusíku při -156 °C (vzorky tkání)

Vzorek je získán a zpracován dle platných standardních operačních postupů (SOP) BBM 1. LF UK. Čas mezi odběrem a přípravou vzorků je dán příslušným SOP. Všechny údaje o zpracování vzorku se zaznamenají do databáze biobanky. Přítomnost a kvalita nádorové tkáně je v odebraných vzorcích potvrzena patologem buď zmrazeným řezem, nebo v rámci definitivního vyšetření.

Připravují se následující typy vzorků:

Tkáň:

• zmrazená tkáň: alikvoty o rozměrech 2-3 x 4 x 7 mm
• tkáň uchovaná v RNA lateru: alikvoty o rozměrech 2-3 x 4 x 7 mm

DNA:

• izolace z plné krve ruční vysolovací metodou či automatickým analyzátorem

Krev:

• plná krev
• sérum – alikvoty po 0,5 ml
• plasma – alikvoty po 0,5 ml

Moč:

• alikvoty po 0,5 ml

Likvor:

• alikvoty po 0,5 ml

Vzorky jsou pro BBM 1. LF UK zajišťovány nejčastěji ve spolupráci se Všeobecnou fakultní nemocnicí v Praze (VFN Praha). Odebírají se na základě podepsaného souhlasu dárce vzorku či osoby blízké. Vzorky jsou získávány od pacientů s různými typy chorob, zejména nádorovými a vzácnými onemocněními, během plánovaných vyšetření či chirurgických zákroků. Dále jsou získávány vzorky od zdravých dárců (kontrolní vzorky) a to nejčastěji během plánovaných vyšetření či odběrů. Vzorky od zemřelých dárců se získávají na základě souhlasu blízké osoby.

Nejčastěji se získávají různé typy tkání, krev a moč. Vzorek je odebrán, zpracován a uchován dle platných standardních operačních postupů BBM 1. LF UK.